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康普森小麦90K基因分型芯片 ——全面、高效定位/育种               

小麦是我国重要的粮食作物,基因组庞大,所以小麦芯片对于研究小麦的产量、品质及抗性等性状的遗传基础至关重要。北京康普森生物与北京市农林科学院北京杂交小麦工程技术研究中心合作开发了一款高质量定制芯片:康普森小麦90K基因分型芯片(KPS Wheat 90K Chip),可应用于品种鉴定、遗传多样性分析、种质资源遗传背景分析、遗传图谱构建、基因定位、关联分析以及分子标记辅助育种等方面研究。

位点数目:84,661

芯片规格:96样本/芯片

Array design process

芯片设计流程

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Array Characteristics

芯片特点

  •                            

    密度高

     84,661个二态SNP位点,平均遗传距离<0.1cM                                        
  •                            

    质量高

     平均call rate>98%,小麦芯片中有效检出率最高的芯片
  •                            

    适用范围广

     通过育成品种筛选,经过推广品种等验证,适合所有小麦品种
  •                            

    高质量标记多

     所有标记均清晰可见,PHR位点>83%,是目前高质量位点占比最高的芯片
  •                            

    多态性高

     MAF>0.2,能区分近等基因系,两亲本分离群体中多态性>50%
  •                            

    基因组信息清楚

     所有标记位置明确,且部分标记功能清楚,主要与品质、抗病、产量等性状有关
  •                            

    分布较均匀

     A基因组占38.0%,B基因组占39.6%,D基因组占22.4%
  •                            

    性价比高

     中高密度芯片中有效位点占比高,应用更广泛

Array Application

芯片应用

  • 科研应用 /Research Application                            
                               
    遗传图谱构建
    群体进化
    QTL、GWAS、BSA定位
  • 产业应用 /Industrial Application                            
                               
    分子标记辅助选择育种
    小麦育成品种确权
    小麦DNA指纹图谱鉴定