高质量、适用范围广,这款芯片能满足你对小麦芯片的所有需求

来源: 发表日期:2018-04-19 浏览量:260

 

中国是世界上最早种植小麦的国家之一,在几千年的发展过程中,小麦也早已成为中国人食谱中重要的组成部分。因此对小麦的研究一直是我国农作物研究非常重要的一环,但在实际的过程中,因小麦基因组的庞大而复杂,带来了很多难以解决的问题。

近年来,随着分子育种的高速发展,用中高密度的小麦基因分型芯片进行分析,已经能大大缩短分析时间,节约成本提高效率,这也已经成为了小麦研究的主流方式之一。

与市场上的大多数芯片不同,北京康普森生物技术有限公司北京市农林科学院北京杂交小麦工程技术研究中心合作开发的康普森小麦90K基因分型芯片(KPS Wheat 90K Chip),拥有着选用位点质量高适用范围广的优点。

芯片推出后,许多老师都对小麦90K芯片进行了咨询,这里特地来给大家来详细的介绍一下。

 

 


 


第一、芯片设计

层层筛选,是小麦90K芯片高质量的原因

 

 

 

第二、芯片优势

 

一、中高密度,质量高

芯片包含84,661个SNP位点,均为二态位点,平均遗传距离小于0.1cM,平均call rate>98%,有效检出率在市面上所有小麦芯片中非常有竞争力

二、适用范围广

通过育成品种筛选,经过中国春、济麦22等涵盖我国十大麦区大面积推广品种、骨干亲本、地方品种等验证,适合所有小麦品种

三、高质量标记多

去除紧密连锁位点的冗余标记,所有标记均清晰可见,Poly High Resolution类型位点>83%,与现有的小麦芯片相比高质量位点占比的优势非常突出

 

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四、多态性高

MAF>0.2,能区分近等基因系;两亲本分离群体中多态性>50%。

五、基因组信息清楚

所有标记物理位置与遗传距离明确。

79个功能标记

1) 产量性状相关基因:包括株高、千粒重、籽粒大小等;

2) 抗病性状相关基因:抗条绣、赤霉病等抗病基因位点;

3) 生长性状相关基因:春化、抗穗发芽、抗逆、品质、熟期、开花期等。

六、分布较均匀

多态性标记在普通小麦基因组中均匀分布

基因组分布图

七、性价比高

与国外同等密度芯片相比,有效标记数约高2倍;

与国内其他芯片相比,属中高密度,有效位点占比更高,应用更广泛。 

 

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第三、芯片应用

群体进化分析

高密度连锁图谱绘制

基因定位(QTL/GWAS/BSA)

小麦育成品种确权

分子标记辅助选择育种

小麦DNA指纹图谱鉴定

康普森基因芯片平台介绍

 

左图为GeneTitan系统右图为Beckman FX自动化工作站

  • 自动化:操作过程减少了人为操作误差,标准化的实验程序可以提高实验的重复性,精准的加样过程使得1μL样品的实验误差不超过3%。

  • 高通量: 每周可扫14张片子,1344样本。

  • 实验周期短:400个以下,指定样本后,最短10工作日内交付数据。

 

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电话:400-186-9509


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