玉米遗传育种产业服务

玉米不仅是我国重要的粮食作物,也是重要的工业原料和生物能源。通过玉米育种芯片,如Kps玉米6H90K芯片等,可以快速进行玉米DNA指纹鉴定、基因定位、群体进化分析及种质资源鉴定等,为玉米育种产业服务奠定基础。

玉米分子育种平台

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Technological process

技术流程    


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    step 1        


           


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    step 1        


           


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    step 2        


           


  •            

    step 3       


           

  • Illumina®平台原理与实验流程

    对基因组DNA进行定量;

    非PCR扩增;

    片段化gDNA、沉淀与重悬浮;

    杂交:DNA片段变性后,与芯片上特异的50 mer寡核苷酸探针形成退火,一种微珠类型对应一个SNP位点;

    延伸与染色:洗去未杂交和非特异杂交的DNA之后,在芯片上进行单碱基延伸,单碱基添加了特异的荧光基团,从而可区分样本的SNP基因型。

  • AxiomTM平台原理与实验流程

    DNA定量后进行DNA扩增;

    片段化gDNA、沉淀与重悬;

    变性与杂交:DNA片段变性后与芯片上的特异的30 mer寡核苷酸探针形成退火,一种类型对应一个SNP位点;

    延伸、连接与染色:洗去未杂交和非特异性杂交的DNA之后,带有特定荧光基团的检测探针与正确碱基配对后连接,从而区分SNP的基因型。

Sample requirements

样本要求

  • DNA样品

     总量:

    ≥ 1.0μg

     浓度:

    ≥ 50ng/μL

  • 组织样本

     总量:

    ≥ 100mg

  • 血液样本

     总量:

    ≥ 2mL

Credit analysis

生信分析

  • 基本分析 /Basic analysis
    芯片质控分析
    样本质控分析
    SNP分型结果
    SNP Plink格式的分型结果
  • 高级分析 /Advanced analysis
    选择信号分析
    时间序列分析
    亲缘关系鉴定
    进化分析
    品种鉴定
    Haploview分析
    CNV分析
    全基因组关联分析
  • 个性化分析 /Personalized analysis
    两个样本之间SNP分型差异位点统计
    两个样本之间相同SNP分型位点统计
    比较组间交集SNP