棉花遗传育种产业服务
棉花是我国重要的农作物之一,棉纤维与人们的日常生活息息相关。通过利用全基因组的基因分型芯片,如kps棉花80K芯片等,可以解析棉纤维产量及品质的遗传机制,为棉花的遗传育种产业服务提供良好的指导。
棉花分子育种平台
Illumina®平台原理与实验流程
对基因组DNA进行定量;
非PCR扩增;
片段化gDNA、沉淀与重悬浮;
杂交:DNA片段变性后,与芯片上特异的50 mer寡核苷酸探针形成退火,一种微珠类型对应一个SNP位点;
延伸与染色:洗去未杂交和非特异杂交的DNA之后,在芯片上进行单碱基延伸,单碱基添加了特异的荧光基团,从而可区分样本的SNP基因型。
AxiomTM平台原理与实验流程
DNA定量后进行DNA扩增;
片段化gDNA、沉淀与重悬;
变性与杂交:DNA片段变性后与芯片上的特异的30 mer寡核苷酸探针形成退火,一种类型对应一个SNP位点;
延伸、连接与染色:洗去未杂交和非特异性杂交的DNA之后,带有特定荧光基团的检测探针与正确碱基配对后连接,从而区分SNP的基因型。
Sample requirements
样本要求
DNA样品
总量:≥ 1.0μg
浓度:≥ 50ng/μL
组织样本
总量:≥ 100mg
血液样本
总量:≥ 2mL