芯片设计特点

先进性

• 按功能区分标记类型：因果突变、紧密关联、一般关联、基因组分布点

• 包含控制重组率基因：可通过重组增大表型变异，增加遗传进展

• 因果基因效应已知：部分功能检测不需要构建参考群，新测表型可纳入现有参考群中更新效应

• 芯片可升级：可依据增测的表型数据和填充后的基因组全序列不断增加因果位点和紧密关联点数目，升级芯片

• 考虑冷热点：考虑重组冷热点，设计芯片分布密度

• 评估方法先进：可根据标记效应给予权重或自定义权重计算出亲缘关系矩阵，估算的显性效应能有效用于个体选配方案制定

全面性

• 评估群体全面：杜长大、F2 资源家系、两头乌、苏太、嵌合家系、莱芜、二花脸、巴马香、疝气等9 个群体作为参考群

• 评估性状全面：涵盖从出生到屠宰整个生育期的繁殖、生长肥育、胴体、肉质、免疫等7 大类422个性状

• 单倍型库全面：目前已有涵盖杜、长、大主要商业品种及中国六大类地方品种高覆盖度的基因组全序列单倍型库