新闻快讯|中国农业大学与康普森生物召开牛基因芯片设计开发研讨会,助力牛产业体系发展

来源: 发表日期:2022-06-08 浏览量:1891



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为加快牛种业发展,中国农业大学与北京康普森生物技术有限公司经过三年多的努力,联合开发了牛200K高密度基因芯片,满足不同品种奶牛、肉牛的基因组选择、品种鉴定、群体分析、基础研究等应用,解决了基因组育种中重要的工具性问题。该芯片由国内团队自主设计,拥有自主知识产权,芯片生产平台依托多个平台同时实现,既解决了高效应用问题,也解决了供应链上卡脖子风险。

为论证此芯片开发设计的合理性,6月5日,召开牛芯片产品线上研讨会。研讨会由中国农业大学动物科技学院刘剑锋副院长主持,并邀请到各管理部门、科研专家、企业代表一同参加。



01
会议内容


首先,中国农业大学姜力副教授对肉牛、奶牛通用芯片产品设计工作进行了设计思路及开发成果展示:


设计背景

1. 我国奶牛参考群体初具规模,肉牛饲养品种多,单一品种群体规模有限;

2. 奶牛、肉牛存在大量共有SNP,但等位基因频率存在明显差异;

设计思路

1. 在保证一定MAF的前提下,筛选多品种共有SNP为主,补充不同品种特有SNP为辅;

2. 以奶牛应用为主,兼顾大众肉牛品种的育种应用;

产品优势

1. 基因组育种,兼顾系谱鉴定、重要经济性状功能位点、品种鉴定等;

2. 可固相芯片、靶向捕获测序灵活选择,降低成本;

应用场景

1. 奶牛、肉牛基因组选择、全基因组关联分析、品种鉴定、亲子鉴定;

2. 扩大某些性状评估的参考群规模;


接下来,各领导专家讨论中国牛基因组育种的应用及奶牛育种生产实践遇到的问题,对牛基因芯片进行评价并给出指导建议。


厉建萌 
  农村部种业管理司 创新发展处二级调研员

奶牛和肉牛通用芯片的研制很有意义,这款通用芯片在技术上是一个集成创新,对于这些新技术,要积极创造一个好的创新环境,支持和鼓励新技术不断成熟化发展。

奶牛和肉牛通用芯片的研制正当其时。目前全社会广泛关注畜禽育种,种业振兴行动方案通过后,各省都在制定地方种业振兴方案,出台一系列措施。奶牛肉牛育种联合攻关、遗传改良计划也取得了一些重要进展。此款芯片的研发,对于新时期加快奶牛、肉牛育种进程、提高生产性能将产生积极促进作用。


张桂香 副处长

  全国畜牧总站

张处长表示这项工作对牛的育种工作来说是一个喜事,希望我们开发的育种芯片,能够在市场推广应用和育种体系构建方面发挥更大的作用。其次,在芯片的设计和开发过程中,从芯片的设计、检测、数据分析一直到评估完成,要逐渐实现完全的独立自主,这对我国种业发展是非常重要的。


陈绍祜 副秘书长
  中国奶业协会

基因组选择技术优势凸显,在奶牛的早期选育、公牛缩短世代间隔方面,都起到很大的推进作用。推出一款自主研发的奶牛基因检测芯片对种业的发展、种业安全意义重大。现在国内每年用于种公牛评估的参考群与国际相比差距很大,这款芯片如何能建立一套全面的应用体系,值得深入研究和探索,只有把模式建立起来,与商业应用结合,双管齐下,这样参考群不断扩大,商业服务不断推进,服务质量才能不断提升。


随后,其他专家代表及企业领导介绍了各自基因组育种工作的开展情况及在应用中的现实需求,同时对即将推出的牛基因芯片提出了建议和展望,参会专家领导包括:天津市农业科学院研究员、天津奶牛(肉羊)产业技术体系首席专家马毅,认为国内市场如果开发一款兼用牛育种利器将会很有前景;宁夏畜牧总站站长温万表示,奶牛肉牛通用芯片在解决种业卡脖子问题上有很大突破;河北省畜牧良种工作总站站长倪俊卿对利用此款芯片,如何能在选育过程中发挥优中选优的作用展开了探讨;以及3位来自企业的代表,均对实际应用需求、参考群以及成本问题发表了意见。


刘继强 董事长
  康普森生物

康普森生物董事长做了关于牛基因芯片合作推广的展望汇报:康普森作为致力于基因组产业应用的公司,先后推出了猪、鸡、大豆、玉米等一系列芯片,在产业应用上都取得了不错的成绩,此次推出牛基因芯片,综合考虑了国外及国内产品的现实情况。以保证质量为前提,在同等规格下,使我们的产品在国内同等产品中价格最优,能和国外的产品相媲美,让中国的种养殖户用上真正意义上质优价廉的国产芯片,更重要的是通过该项技术的推广让种业企业获得真正的收益,促进中国种业发展。

康普森在做基因组产业推广过程中积累了很多经验,包括现在做的一些工作,相信在短时间内能在产业中有一个量的突破,通过量的突破来提升质的突破,未来这款芯片所服务的牛场或养牛大户越来越多,增加我们的参考群体,提高遗传评估体系的准确性。

款芯片有两个特点,一个特点是设计思路,覆盖奶牛肉牛;第二个特点是固相芯片和靶向捕获测序联动,根据应用场景的不同来转换,极大提高技术的自主性、灵活性以及成本可控性。于育种目标聚焦奶牛与肉牛遗传评估体系的完善,基于芯片平台,需要和专家同行们一起,解决包括遗传评估体系算法、性状测定、选择指数制定、育种方案等问题,建立起相应的评估体系、数据体系。

康普森会尽最大的努力做到自主知识产权的全覆盖,这也需要各位老师各位专家的帮助和支持,共同助力中国牛产业发展。


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康普森介绍


北京康普森生物技术有限公司成立于2011年,是国家高新技术企业,“专精特新”中小企业,北京市级企业科技研究开发机构。康普森生物秉承“面向农业、深入产业”,已形成科研、技术、产业相互促进的发展模式。公司先后创建基因检测平台、育种分析大数据平台,智慧农业平台,致力于打造新一代育种创新平台。在未来的发展中,康普森生物将依托先进的测序和检测技术、高效的信息分析能力、丰富的种质资源、以多学科结合的新型育种创新体系为基础,为打好种业翻身仗、推动我国由种业大国向种业强国奠定基础。



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