基因组选择(Genomic Selection, GS)是利用基因组的遗传标记信息计算育种值用于选种的方法。它就是全基因组范围上的标记辅助选择,是传统MAS选择的升级。通过检测覆盖全基因组的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对猪个体进行遗传评估,依据评估得到的基因组育种值对待选群个体进行排名选择, 从而提高选择的准确性, 加快遗传进展。
通过大量的遗传变异,对受多个基因控制的复杂性状(如肉质、繁殖性能等),基因组选择能够更精准地评估个体的遗传潜力,提高选择的准确率。
通过早期基因筛选,缩短育种周期,实现更快的遗传改良。
早期选育能减少不合格个体的育种成本,提高资源利用效率。
降低群体的近交增量,防止近交衰退。
系谱纠偏是基于孟德尔遗传定律,即每个遗传位点的等位基因均以孟德尔遗传方式由亲本传递给后代。在疑似亲本和疑似后代个体所构成的待检测亲子对间,可对每一个双等位基因的遗传位点进行孟德尔错误判定。这项服务不仅能够降低近交风险,还能帮助企业优化猪群管理,提高生产性能和繁殖效率,实现更科学的选种和育种决策。
亲子鉴定/系谱纠偏鉴定准确性高达99.99%以上。
基于分子数据,1天内可完成对系谱的检验、纠偏。
有效避免近交引发的健康与繁殖问题。
减少错误系谱对选种的影响提升育种效率。
避免因系谱错误导致的选育资源浪费。
系谱纠偏 |
样本总量 |
错误量 |
错误率 |
纠偏后错误率 |
使用前 |
3324 |
532 |
16% |
10.68% |
使用后 |
5299 |
244 |
4.60% |
0.30% |
核心种群是企业育种工作的基石,品种的纯度和血统构成直接影响下游产品质量和育种效果;但由于国内现有种质资源缺乏监管且不同企业育种模式差异较大等问题,导致企业对自身或引入的核心种源遗传背景缺乏深入了解。针对此问题,康普森公司基于大规模种质资源数据库+自主研发基因检测产品+血统溯源分析算法,开发了成熟的商业化品种血统分析体系,帮助企业更好地了解种质资源的纯度及来源。
数据库来源于中芯一号芯片和重测序数据等数十万样本数据。
康普森种猪数据库中收录了常见的法系、丹系、加系、美系、台系和英系的杜长大种猪基因数据,如Axiom、Cooperl、丹麦基因、丹育国际、加裕、FAST、Waldo、Cedar Ridge、Acuity等不同企业的样本数据。
进入数据库的样本充分考虑了性别、家系信息并通过似然值、留一法等统计算法分析,经过了多次测试优化,保证了数据库样本的代表性及多样性。
类型 |
样本编号 |
数量 |
纯种大白 |
1,2,3,8,9,10,11,15,18,23,24,25,26,27,28 |
15 |
纯种大白 |
5,7,12,22,29,30 |
6 |
二元种猪 |
4,6,13,14,17,19,20,21 |
8 |
三元猪 |
16 |
1 |
发生应激综合征的猪,其肉质苍白、松软,切面渗水,称为 PSE 肉。实验用氟烷麻醉剂可诱导猪应激综合征的发生,对氟烷敏感性状是由一对等位基因 Hal 控制。猪氟烷基因(Hal)是影响猪肉品质的一个重要的标记基因,该基因的隐性纯合子猪只容易发生应激综合征,敏感个体易在应激条件下猝死,产生 PSE 肉(白肌肉)或DFD 肉(黑干肉)的频率较高,对猪肉品质产生负面影响,从而导致生产上的巨大损失。为此,对核心育种场和综合试验站种猪长期开展氟烷基因筛查工作, 淘汰 RYR1-TT 基因型或者是携带 Hal 隐性纯合基因型的个体尤为重要。