中国水产科学研究院珠江水产研究所赵建研究员团队与北京康普森农业科技有限公司联合开发了一款适合于乌鳢的靶向捕获育种芯片 ——“乌鳢50K育种芯片”。该芯片包含了50K个高质量的SNPs位点,涵盖了与性别相关的功能位点,适用于乌鳢全基因组选择育种、新品种培育、群体家系构建及系谱鉴定等基础研究。
产品信息 |
关键参数 |
乌鳢50K育种芯片 |
标记信息 |
标记类型 |
SNP |
标记总数 |
50000 |
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性别相关位点 |
230 |
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技术类型 |
康普森CAGT®靶向捕获测序技术 |
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测序群体 |
山东、浙江、安徽、湖北、湖南、四川、天津、黑龙江等地区乌鳢以及白乌鳢、金乌鳢 |
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参考基因组 |
GCA_033026475.1 |
由中国水产科学研究院生物技术研究中心李炯棠研究团队联合与北京康普森农业科技有限公司开发了一款适合于鲤选育、品种鉴定等多用途的基因育种芯片 ——“鲤育一号”(图2)。该芯片包含了20K个高质量的SNP位点,为鲤鱼产业提质增效,选育优质、高产、耐粗、高抗、耐密等优异性状的鲤鱼良种提供有力的技术支撑。
“鲤育一号”采用康普森CAGT(®)靶向捕获测序技术,含有16种主养鲤鱼的全基因组重测序变异和重要经济性状关联标记。“鲤育一号”芯片位点覆盖全基因组选择育种效应大的位点和涵盖多种鲤鱼群体多态性标记。该芯片含有鲤鱼营养品质性状(粗蛋白、粗脂肪、氨基酸、脂肪酸、肌肉质构、肌间刺、纹段等)、血液成分及含量、性别等性状的分子标记18056个,此外还包括区分16种鲤品种特异性位点144个,可用于重要性状的育种值估计和品种确权保护。通过样本芯片测试,“鲤育一号”芯片,产品位点检出率高,平均检出率达到了95.18%,产品稳定性好、基因型准确高,重复样本平均分型一致率为98.77%,产品性能优良。
产品信息 |
关键参数 |
“鲤育一号”育种芯片 |
标记信息 |
标记类型 |
SNP |
标记总数 |
20359 |
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鲤鱼营养品质性状、血液成分及含量、 |
18056 |
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品种鉴定位点 |
144 |
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技术类型 |
康普森CAGT®靶向捕获测序技术 |
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参考基因组 |
GCF_018340385.1 |
中国水产科学研究院珠江水产研究所赵建研究员团队与北京康普森农业科技有限公司联合开发了一款适合于斑鳢品种的靶向捕获育种芯片 ——“斑鳢50K育种芯片”。该芯片包含了50K个高质量的SNPs位点,628个与重要性状相关的功能位点,涵盖了生长、性别以及抗病等多个重要性状,适用于斑鳢全基因组选择育种、新品种培育、群体家系构建及系谱鉴定等基础研究。
产品信息 |
关键参数 |
斑鳢50K育种芯片 |
标记信息 |
标记类型 |
SNP |
标记总数 |
50000 |
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生长、性别、抗病等性状功能位点 |
628 |
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技术类型 |
康普森CAGT®靶向捕获测序技术 |
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测序群体 |
广东、广西、湖南、福建、台湾地区斑鳢 |
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参考基因组 |
GCA_020496755.1 |