优秀案例
利用重测序揭示大足黑山羊繁殖性状全基因组关联研究
本研究选取150个大足黑山羊群体样本进行重测序,测序深度>6×,筛选出18个与产子数等繁殖性状显著关联的SNP位点,10个与乳房性状显著关联的SNP。获得ATP1A1 、 LRRC4C 、 SPCS2 、 XRRA1 、 CELF4 、 NTM 、 TMEM45B 、 ATE1 和 FGFR2 与乳房性状相关候选基因,和 ENSCHIG00000017110 、 SLC9A8 、 GLRB、 GRIA2 、 GASK1B 和 ENSCHIG00000026285基因与产仔数相关候选基因。
图1 繁殖相关性状显著关联位点
参考文献
Fang X, Gu B, Chen M, Sun R, Zhang J, Zhao L, Zhao Y. Genome-Wide Association Study of the Reproductive Traits of the Dazu Black Goat (Capra hircus) Using Whole-Genome Resequencing. Genes (Basel). 2023 Oct 19;14(10):1960. doi: 10.3390/genes14101960. PMID: 37895309; PMCID: PMC10606515.